Важной частью программной политики АО «Желдорипотека-строй» является внедрение инноваций. Современные технологии позволяют компании повысить производительность и эффективность труда, сохраняя высокое качество работы. Инновационная деятельность Общества ведется в соответствии с Программой инновационного развития Общества на период до 2025 года. Инновационная повестка также включена в проект Стратегии развития Общества до 2025 года.